Если фигура ничем не обведена и не залита, то ты видишь пиксели своего монитора, а если фигура имеет обводку или заливку, то ты видишь пиксели документа... это не проблема, все верно, так и должно быть - фотошоп растровый редактор и перо лишь ВСПОМОГАТЕЛЬНЫЙ элемент, оно НЕ часть изображения.
Интересно другое - а что ты ожидал увидеть то? Даже в векторном редакторе вроде Corell? Чернила что ли? Или краски? Может линию карандашом? ВСЕ изображения - это пикселы.