Ничего страшного и критического не произойдёт, если ты об этом. Просто в тот момент, когда машина захочет загрузить Систему, она не найдёт соответствующего носителя, и поэтому загрузка остановится, с выводом соответствующего сообщения на экран. После этого можно спокойно выключить системный блок.
Если, вдруг, тебе это зачем-то надо – вот так.